More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2904 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  100 
 
 
503 aa  1018    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  50.41 
 
 
499 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  47.98 
 
 
524 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.07 
 
 
524 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  47.77 
 
 
524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  47.77 
 
 
524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  47.77 
 
 
524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  47.98 
 
 
524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.86 
 
 
518 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
527 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 
523 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
525 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.84 
 
 
497 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  46.94 
 
 
512 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.08 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  46.53 
 
 
513 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  45.64 
 
 
513 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  45.51 
 
 
515 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.8 
 
 
499 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  46.04 
 
 
513 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  46.23 
 
 
516 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.16 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  45.31 
 
 
511 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  46.85 
 
 
513 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.44 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  45.15 
 
 
520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  46.53 
 
 
521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  44.42 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  45.15 
 
 
509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  47.73 
 
 
508 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.07 
 
 
504 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.25 
 
 
495 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.95 
 
 
513 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.62 
 
 
515 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  43.12 
 
 
505 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 
517 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.12 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  44.77 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  44.58 
 
 
517 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  44.77 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  44.02 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  44.97 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.77 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.77 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
494 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
494 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.06 
 
 
517 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  45.18 
 
 
511 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
494 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  44.49 
 
 
517 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  44.29 
 
 
517 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  42.91 
 
 
507 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  46.79 
 
 
512 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  44.29 
 
 
495 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 
494 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.15 
 
 
497 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
494 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.32 
 
 
520 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
506 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
506 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.04 
 
 
517 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.14 
 
 
506 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
494 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.78 
 
 
503 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  45.74 
 
 
518 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
506 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
494 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.9 
 
 
506 aa  428  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
494 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.56 
 
 
492 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.53 
 
 
501 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
510 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.45 
 
 
511 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.13 
 
 
506 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
506 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
506 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  44.13 
 
 
506 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  43.15 
 
 
506 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
506 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  43.2 
 
 
501 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.42 
 
 
501 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.22 
 
 
514 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
506 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
496 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43 
 
 
515 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  41.34 
 
 
504 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  42.33 
 
 
495 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.41 
 
 
495 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  43.06 
 
 
500 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
506 aa  428  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  46.95 
 
 
503 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
511 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
506 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  46.34 
 
 
503 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>