More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2870 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
342 aa  691    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  45.07 
 
 
337 aa  296  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  42.26 
 
 
341 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  42.99 
 
 
339 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 
337 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 
340 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  38.14 
 
 
342 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  38.99 
 
 
343 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  38.69 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  38.69 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  38.69 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  38.69 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  38.69 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  38.69 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  38.14 
 
 
340 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  38.39 
 
 
343 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  38.14 
 
 
343 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.95 
 
 
336 aa  242  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 
340 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  36.53 
 
 
341 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 
337 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  39.16 
 
 
336 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 
348 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 
335 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  35.54 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  38.69 
 
 
343 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 
338 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.74 
 
 
330 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  37.43 
 
 
340 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 
330 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 
339 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 
339 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.66 
 
 
340 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 
340 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.33 
 
 
353 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.5 
 
 
336 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  39.1 
 
 
339 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 
346 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.31 
 
 
335 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 
336 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 
336 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.84 
 
 
347 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.21 
 
 
333 aa  195  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.53 
 
 
332 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  39.69 
 
 
343 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.53 
 
 
332 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 
353 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.23 
 
 
332 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 
339 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  38.35 
 
 
349 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.23 
 
 
332 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.23 
 
 
332 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.23 
 
 
332 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 
336 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.82 
 
 
337 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.25 
 
 
337 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.23 
 
 
332 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  32.93 
 
 
332 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  32.93 
 
 
332 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  32.93 
 
 
332 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.93 
 
 
332 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 
340 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  40.13 
 
 
333 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  37.85 
 
 
332 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 
386 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  36.12 
 
 
337 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.31 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.13 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.31 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.31 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 
332 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  34.52 
 
 
332 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 
355 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  37.61 
 
 
338 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 
337 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 
341 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 
331 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  34.23 
 
 
332 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 
334 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 
341 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 
337 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  36.01 
 
 
343 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  37.79 
 
 
349 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 
343 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 
332 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 
343 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 
343 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
332 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 
343 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  37.21 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  40 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.5 
 
 
338 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>