More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2865 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
311 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  47.59 
 
 
307 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  46 
 
 
307 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  43.58 
 
 
305 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  48.91 
 
 
312 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  48.54 
 
 
332 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  48.2 
 
 
312 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  37.19 
 
 
311 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  36.59 
 
 
315 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
314 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 
301 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  30.32 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  28.47 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  29.96 
 
 
307 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 
316 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 
306 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  28.19 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 
345 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.76 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  27.65 
 
 
317 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 
318 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 
314 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 
314 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  25.09 
 
 
314 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  27.68 
 
 
306 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 
316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 
301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  29.18 
 
 
312 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 
314 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 
301 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 
305 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 
316 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  24.37 
 
 
314 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 
307 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  24.37 
 
 
314 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
309 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  24.37 
 
 
314 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  24.01 
 
 
314 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
309 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  24.73 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 
329 aa  99  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 
335 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.27 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
307 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.21 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  29.35 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  26.38 
 
 
307 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
341 aa  92.8  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.52 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  27.35 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.12 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  22.82 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 
335 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  26.94 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 
315 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 
310 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 
319 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 
305 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
316 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 
316 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  26.13 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  29.63 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  26.51 
 
 
306 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 
312 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  26.84 
 
 
327 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.18 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  21.71 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>