More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2780 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  100 
 
 
356 aa  726    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  67.32 
 
 
355 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  67.32 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  67.04 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  67.04 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  67.04 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  67.04 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  67.32 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  67.04 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  67.04 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  66.76 
 
 
358 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  66.76 
 
 
355 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  68.95 
 
 
358 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  65.62 
 
 
355 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  63.1 
 
 
356 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  65.17 
 
 
356 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  68.95 
 
 
358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  65.35 
 
 
355 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  62.61 
 
 
357 aa  455  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  61.93 
 
 
355 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  62.61 
 
 
355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  60.51 
 
 
358 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  60.97 
 
 
359 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 
360 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 
360 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  58.24 
 
 
359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 
358 aa  444  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 
358 aa  444  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 
355 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  61.36 
 
 
355 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  60.4 
 
 
360 aa  428  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 
367 aa  425  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
362 aa  423  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 
356 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  58.24 
 
 
355 aa  421  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 
356 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
357 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 
359 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 
356 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  63.92 
 
 
355 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 
360 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 
361 aa  408  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 
359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
358 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 
355 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 
355 aa  402  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 
359 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
357 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 
362 aa  401  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
359 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 
358 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
360 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  56 
 
 
363 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 
357 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 
358 aa  391  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 
355 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
363 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 
360 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
355 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 
360 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
370 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 
360 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 
357 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
360 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  54.09 
 
 
356 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
372 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 
358 aa  388  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
370 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
355 aa  388  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 
364 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
370 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  50 
 
 
357 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 
355 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  53.16 
 
 
360 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
355 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 
360 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
364 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 
361 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 
360 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 
360 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 
357 aa  384  1e-105  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 
361 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 
365 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
360 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  53.01 
 
 
360 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  56.81 
 
 
354 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 
356 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 
360 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
355 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  53.01 
 
 
360 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  54 
 
 
355 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>