More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2713 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  80.5 
 
 
400 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  76.57 
 
 
397 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  100 
 
 
395 aa  803    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  82.41 
 
 
400 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0189  elongation factor Tu  81.52 
 
 
394 aa  638    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000120666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  76.83 
 
 
396 aa  634    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  76.83 
 
 
396 aa  634    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  82.03 
 
 
395 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  80 
 
 
400 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  81.77 
 
 
395 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  81.77 
 
 
395 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  79.39 
 
 
394 aa  646    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  81.77 
 
 
395 aa  646    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  79.6 
 
 
396 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  83.54 
 
 
395 aa  660    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  76.57 
 
 
397 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  77.81 
 
 
400 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  77.53 
 
 
396 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  77.53 
 
 
396 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  77.83 
 
 
396 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  82.41 
 
 
400 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  84.81 
 
 
395 aa  673    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  80.65 
 
 
400 aa  666    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  81.47 
 
 
396 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  77.81 
 
 
400 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  78.14 
 
 
400 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  79.85 
 
 
396 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  81.77 
 
 
395 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  81.77 
 
 
395 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0585  elongation factor Tu  81.52 
 
 
394 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  77.86 
 
 
395 aa  639    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  78.95 
 
 
400 aa  643    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  79.6 
 
 
396 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  81.5 
 
 
400 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  80.1 
 
 
396 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  80.1 
 
 
396 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.33 
 
 
396 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  79.85 
 
 
396 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  84.56 
 
 
395 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  77.56 
 
 
400 aa  649    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  79.85 
 
 
396 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  74.81 
 
 
405 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  74.81 
 
 
405 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  82.03 
 
 
395 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.83 
 
 
396 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  81.52 
 
 
395 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  77.53 
 
 
396 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  77.53 
 
 
396 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  78.95 
 
 
400 aa  643    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  80.25 
 
 
400 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0571  elongation factor Tu  81.52 
 
 
394 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000209792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  80.5 
 
 
400 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  78.14 
 
 
399 aa  638    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  81.16 
 
 
397 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0129  elongation factor Tu  81.77 
 
 
395 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000035963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  80.65 
 
 
400 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  80.25 
 
 
400 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  79.65 
 
 
400 aa  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  79.65 
 
 
400 aa  656    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  79.8 
 
 
396 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  79.85 
 
 
396 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  77.49 
 
 
396 aa  635    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  77.31 
 
 
400 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  81.16 
 
 
397 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  77.58 
 
 
396 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  77.66 
 
 
394 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  78.09 
 
 
397 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  75.19 
 
 
399 aa  635    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  76.44 
 
 
399 aa  640    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  76.44 
 
 
399 aa  640    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  75.82 
 
 
396 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.07 
 
 
396 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.07 
 
 
396 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.83 
 
 
396 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  76.57 
 
 
396 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  76.83 
 
 
396 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>