More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2710 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  65.38 
 
 		 207 aa  261  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  62.98 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  59.71 
 
 		 206 aa  254  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  59.9 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  56.52 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 		 207 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  62.86 
 
 		 207 aa  248  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  247  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  57.77 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  55.07 
 
 		 207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  51.94 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  53.85 
 
 		 208 aa  227  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  52.66 
 
 		 207 aa  227  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  53.85 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  56.04 
 
 		 207 aa  224  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  52.91 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  48.78 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  53.14 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  53.4 
 
 		 208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  52.63 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  50.72 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  52.88 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  47.83 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  52.88 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  51.47 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  48.28 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 		 208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  47.78 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  51.49 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  48.87 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  45.67 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  49.75 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  49.26 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  47.09 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  49.75 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  46.38 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  45.54 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  49.02 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  48.56 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  48.51 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  49.48 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  49.01 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  47.83 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 206 aa  184  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  48.51 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  45.54 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  48.72 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  46.53 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  45.5 
 
 		 210 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  47.69 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  49.73 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 		 223 aa  177  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  48.28 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  46.19 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  45.54 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  44.93 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  43.75 
 
 		 210 aa  175  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  47 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  47.76 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  46.27 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  45.97 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  45.73 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  45.69 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  47.09 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  47.76 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  47.47 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  43.6 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  46.27 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  43.5 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>