More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2707 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  100 
 
 
93 aa  192  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  84.62 
 
 
92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  83.52 
 
 
92 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  76.6 
 
 
94 aa  158  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  79.12 
 
 
92 aa  157  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  80.22 
 
 
92 aa  154  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  77.42 
 
 
93 aa  154  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  75.27 
 
 
95 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
94 aa  152  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 
92 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
92 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  76.09 
 
 
94 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  73.91 
 
 
94 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 
92 aa  150  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
93 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
94 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  77.38 
 
 
94 aa  147  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  74.19 
 
 
93 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 
92 aa  147  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  73.12 
 
 
93 aa  146  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  72.04 
 
 
94 aa  146  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 
91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
95 aa  144  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  70.97 
 
 
93 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  74.19 
 
 
93 aa  143  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  68.82 
 
 
93 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  73.12 
 
 
93 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0200  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
92 aa  143  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.130861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
94 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
91 aa  143  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  73.63 
 
 
93 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
92 aa  142  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  73.12 
 
 
93 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  73.12 
 
 
93 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  70.33 
 
 
91 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  141  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  68.48 
 
 
94 aa  141  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  69.89 
 
 
93 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
91 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  70.65 
 
 
94 aa  141  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  64.52 
 
 
93 aa  141  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  71.11 
 
 
94 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  140  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 
91 aa  140  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 
93 aa  140  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  72.53 
 
 
93 aa  140  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  72.41 
 
 
93 aa  140  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  71.43 
 
 
93 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
94 aa  140  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  68.82 
 
 
93 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258a  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  71.28 
 
 
91 aa  139  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
91 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 
93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>