More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2592 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  38.49 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  39.27 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  36.9 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
304 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 
308 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.28 
 
 
339 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  33.81 
 
 
299 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 
315 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.07 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  36.48 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  33.2 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  36.89 
 
 
365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  31.87 
 
 
325 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  36.63 
 
 
368 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 
360 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  31.87 
 
 
325 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  29.49 
 
 
370 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 
336 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  29.14 
 
 
348 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.04 
 
 
343 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  27.02 
 
 
305 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.66 
 
 
336 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  33.57 
 
 
310 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3004  ApbE-like lipoprotein  36.97 
 
 
274 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.49 
 
 
336 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.63 
 
 
349 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.92 
 
 
332 aa  99.8  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  29.26 
 
 
349 aa  99.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  36.67 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  28.34 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  37.56 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  28.62 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  27.47 
 
 
371 aa  93.6  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  29.24 
 
 
330 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.55 
 
 
322 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  28.16 
 
 
360 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.57 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  30.68 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.07 
 
 
340 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  31.05 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 
353 aa  92.8  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  25.82 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 
351 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  28.51 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  31.03 
 
 
335 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  31.4 
 
 
344 aa  92.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  31.03 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  27.85 
 
 
350 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.24 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  30 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.28 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.67 
 
 
386 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  28.83 
 
 
340 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 
346 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 
346 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  32.7 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 
362 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.11 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  26.18 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  28.35 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  27.07 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 
339 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  28.68 
 
 
275 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  35.62 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  30.38 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  27.18 
 
 
298 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  30.67 
 
 
352 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  24.14 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  33.78 
 
 
325 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  30.24 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  25.28 
 
 
381 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  31.36 
 
 
344 aa  85.9  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  31.16 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  32.55 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  25.96 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  30.58 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  27.47 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  27.05 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  23.17 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  31.44 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  34.15 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  30.91 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  35 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.71 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.91 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.21 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>