More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2429 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 
214 aa  431  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  56.81 
 
 
228 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  53.02 
 
 
212 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  51.16 
 
 
212 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  51.17 
 
 
217 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  50.7 
 
 
217 aa  211  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  49.3 
 
 
217 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  50.7 
 
 
217 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  50.7 
 
 
217 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  50.7 
 
 
217 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  50.7 
 
 
217 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  50.7 
 
 
217 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  50.7 
 
 
217 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  49.77 
 
 
217 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  47.2 
 
 
215 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  47.2 
 
 
215 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  49.3 
 
 
217 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  42.52 
 
 
215 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  38.1 
 
 
217 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  39.13 
 
 
231 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  38.89 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 
517 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.98 
 
 
220 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  41.73 
 
 
394 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 
352 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  44.8 
 
 
301 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 
355 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  43.65 
 
 
351 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  43.65 
 
 
351 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  43.65 
 
 
351 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 
352 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  40.54 
 
 
358 aa  98.6  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 
352 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 
352 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 
352 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  43.48 
 
 
373 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 
351 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  33.5 
 
 
355 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 
375 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 
364 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.62 
 
 
344 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 
387 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.73 
 
 
348 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 
387 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 
371 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  41.41 
 
 
377 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 
347 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 
344 aa  91.3  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  43.56 
 
 
392 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  37.98 
 
 
346 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  40.46 
 
 
383 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  47.87 
 
 
366 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 
373 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  47.12 
 
 
394 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  39.06 
 
 
371 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 
352 aa  89.4  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 
351 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  37.88 
 
 
331 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 
354 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 
328 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 
344 aa  88.6  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  39.84 
 
 
383 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 
365 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 
443 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 
324 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  38.89 
 
 
372 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  46.81 
 
 
374 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  41.51 
 
 
332 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  45.74 
 
 
375 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  44.55 
 
 
388 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.84 
 
 
385 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  36.15 
 
 
390 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  40 
 
 
385 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 
394 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  37.98 
 
 
366 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  44.14 
 
 
388 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  44.23 
 
 
422 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  39.06 
 
 
371 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 
359 aa  85.9  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 
400 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 
356 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.5 
 
 
344 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  45.3 
 
 
405 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  40.91 
 
 
373 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  40.46 
 
 
383 aa  85.5  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 
369 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 
368 aa  85.5  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.5 
 
 
355 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 
383 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41.82 
 
 
372 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  38.68 
 
 
372 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  36.43 
 
 
342 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  41.82 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  40.91 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  39.84 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.67 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>