More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2364 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
409 aa  825  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  42.94 
 
 
414 aa  283  4e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  41.97 
 
 
414 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  41.37 
 
 
395 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  37.56 
 
 
412 aa  263  5e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  262  9e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.34 
 
 
399 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.31963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  37.82 
 
 
412 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  37.31 
 
 
412 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
412 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  39.39 
 
 
409 aa  254  2e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  37.56 
 
 
400 aa  242  8e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 
423 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  34.62 
 
 
395 aa  234  2e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 
409 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  34.34 
 
 
400 aa  226  5e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.03 
 
 
409 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  37.69 
 
 
410 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 
411 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  36.39 
 
 
407 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 
410 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 
408 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 
409 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 
399 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  35.82 
 
 
408 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  34.37 
 
 
411 aa  214  2e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 
385 aa  213  6e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.21 
 
 
413 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  36.86 
 
 
413 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 
413 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  33.94 
 
 
419 aa  201  2e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.99976e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 
371 aa  199  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  33.96 
 
 
426 aa  198  1e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 
390 aa  198  1e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 
354 aa  198  2e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.97 
 
 
399 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  38.29 
 
 
363 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.16 
 
 
432 aa  196  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 
409 aa  196  8e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  33.76 
 
 
391 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  37.59 
 
 
422 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  36.53 
 
 
386 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0483  DNA polymerase family protein  31.44 
 
 
360 aa  194  2e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0359018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  35.13 
 
 
385 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  38.28 
 
 
419 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.34 
 
 
414 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 
356 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 
419 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  35.42 
 
 
437 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  31.27 
 
 
417 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.7173e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.18 
 
 
433 aa  190  3e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  33.85 
 
 
384 aa  190  3e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  30.39 
 
 
432 aa  191  3e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  32.88 
 
 
416 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  31.64 
 
 
345 aa  189  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl328  DNA polymerase IV (PolIV)  29.34 
 
 
370 aa  189  8e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.93875e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  34.39 
 
 
358 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  38.39 
 
 
355 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  38.51 
 
 
381 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  34.15 
 
 
413 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 
425 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 
410 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  36.21 
 
 
359 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 
403 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  33.67 
 
 
397 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 
430 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  32.15 
 
 
389 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.5 
 
 
415 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.43 
 
 
359 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 
413 aa  186  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  32.82 
 
 
418 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  35.2 
 
 
419 aa  186  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  35.52 
 
 
385 aa  186  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.47 
 
 
378 aa  185  1e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  3.1101e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.47 
 
 
378 aa  185  1e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  33.99 
 
 
381 aa  185  1e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 
421 aa  185  2e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  36.72 
 
 
363 aa  184  2e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  38.36 
 
 
428 aa  184  2e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  36.64 
 
 
435 aa  184  2e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  32.82 
 
 
423 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0423  ImpB/MucB/SamB family protein  27.71 
 
 
408 aa  183  4e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0327324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  32.74 
 
 
390 aa  183  5e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  36.39 
 
 
436 aa  182  9e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  36.53 
 
 
399 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  37.43 
 
 
362 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  37.02 
 
 
357 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  34.86 
 
 
407 aa  180  3e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  36.81 
 
 
357 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 
410 aa  179  5e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  35.46 
 
 
432 aa  180  5e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  32.09 
 
 
444 aa  179  6e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.44848e-08  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  36.41 
 
 
417 aa  179  6e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  34.83 
 
 
424 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>