More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2258 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
591 aa  1204    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  68.21 
 
 
579 aa  815    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  48.25 
 
 
593 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2492  extracellular solute-binding protein family 5  47.51 
 
 
568 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000108616  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.59 
 
 
543 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  35.2 
 
 
500 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1185  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
532 aa  252  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
547 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.92 
 
 
498 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1141  extracellular solute-binding protein family 5  32.73 
 
 
612 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.121856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4778  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
600 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1144  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 
608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1520  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 
610 aa  196  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4336  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
599 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168516  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0886  extracellular solute-binding protein family 5  29.83 
 
 
610 aa  169  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2666  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
617 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.67 
 
 
540 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2145  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 
601 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377347  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.5 
 
 
546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.7 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.41 
 
 
538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.71 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
539 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 
534 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8321  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 
643 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
517 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
538 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 
533 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2026  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.55 
 
 
600 aa  120  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00409621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  22.08 
 
 
576 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 
565 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
591 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 
554 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.47 
 
 
575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1376  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.32 
 
 
544 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.268389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1361  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.06 
 
 
544 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0151112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
551 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2106  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.06 
 
 
544 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
559 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
607 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1345  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.06 
 
 
544 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 
522 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.56 
 
 
562 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1925  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.8 
 
 
544 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 
547 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.49 
 
 
575 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.68 
 
 
588 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 
569 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 
584 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.81 
 
 
575 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
564 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
544 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
544 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
567 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
526 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D17  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.55 
 
 
600 aa  104  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
607 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.16 
 
 
580 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  21.61 
 
 
534 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  26.16 
 
 
579 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
527 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.12 
 
 
560 aa  101  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 
589 aa  101  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 
557 aa  101  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 
575 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.46 
 
 
587 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 
572 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.35 
 
 
527 aa  100  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  24.41 
 
 
518 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.35 
 
 
527 aa  100  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1125  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
525 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0107082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1071  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.73 
 
 
525 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0509495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
575 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 
629 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
631 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
594 aa  98.2  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3547  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.73 
 
 
515 aa  98.6  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000727174  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  26.96 
 
 
510 aa  98.6  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
534 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 
580 aa  98.2  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
575 aa  98.2  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.28 
 
 
534 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.87 
 
 
575 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 
578 aa  97.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
573 aa  97.1  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 
544 aa  97.1  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  24.68 
 
 
495 aa  97.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
537 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
534 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
565 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.31 
 
 
562 aa  96.3  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.79 
 
 
556 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.12 
 
 
575 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.21 
 
 
592 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.23 
 
 
575 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.23 
 
 
555 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.23 
 
 
559 aa  95.5  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
541 aa  95.5  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>