More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2172 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  64 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  62.25 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  60.93 
 
 		 187 aa  207  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  60.14 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  58.67 
 
 		 202 aa  197  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  60.81 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  59.06 
 
 		 202 aa  194  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 195 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 195 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 195 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 195 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  60.14 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  60.14 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  58.67 
 
 		 190 aa  193  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 		 166 aa  193  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  56.95 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 152 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  58.39 
 
 		 219 aa  190  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  58.28 
 
 		 225 aa  189  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  57.62 
 
 		 238 aa  187  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  58.22 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  57.79 
 
 		 181 aa  186  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  58.11 
 
 		 154 aa  186  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  62.14 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 		 184 aa  185  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  59.33 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  56.85 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  54.67 
 
 		 173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  53.02 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  56.76 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  55.78 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 194 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  58.65 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  55.1 
 
 		 171 aa  178  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  54.3 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  54.05 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 		 194 aa  177  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 		 194 aa  177  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 173 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  58.78 
 
 		 153 aa  177  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 176 aa  176  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  53.69 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  51.01 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  53.38 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  53.38 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  53.38 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  53.38 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  53.38 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  53.38 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  52.7 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  51.01 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  55.03 
 
 		 249 aa  174  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  53.69 
 
 		 252 aa  174  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  52.29 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  53.42 
 
 		 172 aa  173  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  52.7 
 
 		 178 aa  173  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 178 aa  172  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  51.68 
 
 		 156 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  52.03 
 
 		 173 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  52.67 
 
 		 204 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  51.66 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  54.3 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  54.86 
 
 		 146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  52 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  50.98 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  50.67 
 
 		 176 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 		 174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 176 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 		 182 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  57.33 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  49.66 
 
 		 227 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 184 aa  167  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  52.35 
 
 		 194 aa  167  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  53.15 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  52.05 
 
 		 197 aa  167  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>