More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1950 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  35.84 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  40.6 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  40.6 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  40.6 
 
 		 210 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  38.01 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  37.99 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  34.56 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  36.73 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  38.29 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  39.01 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  35.71 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  37.95 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  36.61 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  33.2 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  33.48 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  35.09 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 202 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  36.07 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  31.98 
 
 		 217 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  36 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  37.33 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  37.33 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  36.12 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  31.53 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  35.24 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  33.92 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 		 215 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  34.21 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  34.36 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  34.36 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  34.8 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  33.92 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 202 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  33.47 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  30.52 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  30.52 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  33.49 
 
 		 202 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 222 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  34.12 
 
 		 193 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  31.25 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 		 227 aa  85.5  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  31.25 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.64 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  27.82 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  44.58 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  24.78 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  24.58 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  38.84 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.12 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  37.84 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  28.44 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  27.04 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  27.15 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  27.04 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>