More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1866 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
495 aa  1005    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 
490 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 
494 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
479 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  52.17 
 
 
495 aa  528  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
501 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
491 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
480 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
477 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
492 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
496 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
465 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
482 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
467 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
485 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
467 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
467 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
468 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
466 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
490 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
485 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
488 aa  413  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
500 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
485 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
463 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
469 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
498 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
471 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
488 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
474 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
474 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
484 aa  392  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
480 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
472 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
474 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
488 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
467 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
470 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  42.94 
 
 
518 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
466 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
469 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
471 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
468 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
494 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
481 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
469 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
492 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
469 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
466 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
466 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
506 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
475 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
502 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
471 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
471 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
471 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
471 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
464 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
471 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
471 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
469 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
502 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
464 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
485 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
471 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
490 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
490 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
502 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40.7 
 
 
471 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
484 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
484 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
471 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
476 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
470 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
471 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  41.26 
 
 
546 aa  364  3e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
535 aa  363  4e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
484 aa  363  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
473 aa  363  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
471 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
471 aa  362  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
471 aa  362  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
490 aa  361  1e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
480 aa  362  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
476 aa  361  2e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>