More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1804 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  100 
 
 
172 aa  345  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  43.43 
 
 
192 aa  130  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  44.17 
 
 
170 aa  129  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  43.98 
 
 
170 aa  128  4e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  43.53 
 
 
174 aa  127  9e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  43.29 
 
 
199 aa  124  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2922  shikimate kinase II  40.94 
 
 
173 aa  124  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  43.75 
 
 
191 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  42.86 
 
 
176 aa  120  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1460  shikimate kinase  47.93 
 
 
168 aa  120  1e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00429425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  42.17 
 
 
173 aa  120  1e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  40.62 
 
 
172 aa  119  2e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  42.07 
 
 
173 aa  118  5e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  40 
 
 
166 aa  117  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  37.87 
 
 
173 aa  117  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3113  shikimate kinase II  38.82 
 
 
173 aa  116  1e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  44.85 
 
 
169 aa  115  2e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  38.24 
 
 
174 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  35.62 
 
 
185 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  39.51 
 
 
181 aa  115  4e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  40.61 
 
 
178 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  44.1 
 
 
175 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  40.85 
 
 
171 aa  114  8e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  39.39 
 
 
174 aa  114  8e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.41 
 
 
174 aa  113  1e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  44.24 
 
 
168 aa  114  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  40.12 
 
 
169 aa  113  1e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  38.18 
 
 
174 aa  112  2e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  37.13 
 
 
173 aa  112  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  37.35 
 
 
170 aa  112  2e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  38.18 
 
 
174 aa  112  2e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  45.34 
 
 
175 aa  112  2e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  42.17 
 
 
190 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  41.57 
 
 
177 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  37.58 
 
 
168 aa  111  4e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  35.37 
 
 
185 aa  112  4e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  37.89 
 
 
539 aa  111  4e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  43.62 
 
 
182 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  39.46 
 
 
169 aa  110  7e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  38.12 
 
 
171 aa  110  1e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  42.77 
 
 
519 aa  109  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  36.02 
 
 
172 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  39.08 
 
 
184 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  38.46 
 
 
199 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  35.5 
 
 
182 aa  108  4e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  6.85723e-07 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  42.77 
 
 
183 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  41.22 
 
 
229 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  37.58 
 
 
177 aa  107  7e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  37.28 
 
 
264 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0444  shikimate kinase II  39.63 
 
 
181 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.647174  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  37.89 
 
 
181 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  43.05 
 
 
183 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  36.36 
 
 
176 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0486  shikimate kinase II  39.02 
 
 
181 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0431  shikimate kinase II  39.02 
 
 
181 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0425  shikimate kinase II  38.32 
 
 
181 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  37.13 
 
 
195 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  41.5 
 
 
184 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  36.14 
 
 
165 aa  104  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0305  shikimate kinase II  38.32 
 
 
174 aa  104  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0426  shikimate kinase II  38.32 
 
 
181 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  0.531253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0418  shikimate kinase II  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  37.28 
 
 
197 aa  104  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0415  shikimate kinase II  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00339  hypothetical protein  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  34.15 
 
 
185 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0456  shikimate kinase II  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00335  shikimate kinase II  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  33.54 
 
 
185 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0462  shikimate kinase II  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3244  shikimate kinase II  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0812303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3220  Shikimate kinase  38.32 
 
 
174 aa  104  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  38.46 
 
 
165 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1731  shikimate kinase  42.86 
 
 
180 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  37.13 
 
 
179 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1406  shikimate kinase  36.69 
 
 
202 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.812389  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  38.15 
 
 
190 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  41.5 
 
 
184 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0877  Shikimate kinase  43.04 
 
 
176 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.317471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  39.24 
 
 
192 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  37.5 
 
 
175 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  33.73 
 
 
176 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  37.5 
 
 
175 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  36.31 
 
 
188 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  42.28 
 
 
175 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  42.67 
 
 
184 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  38.73 
 
 
161 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  41.89 
 
 
183 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  33.94 
 
 
176 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  39.33 
 
 
199 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  33.92 
 
 
198 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2020  shikimate kinase  42.42 
 
 
173 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2361  shikimate kinase II  35.93 
 
 
175 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.314592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  38.93 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  38.93 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  38.93 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  38.93 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1091  shikimate kinase  40.24 
 
 
172 aa  101  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.393566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  38.93 
 
 
177 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  38.03 
 
 
161 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>