More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1780 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  100 
 
 		 166 aa  328  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  45.93 
 
 		 130 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  43.85 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  41.98 
 
 		 138 aa  104  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  40.14 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  41.54 
 
 		 130 aa  101  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  55 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  55 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  39.23 
 
 		 140 aa  97.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  46.27 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  34.51 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  94  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  40 
 
 		 130 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  37.32 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  39.69 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  35.42 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  36.55 
 
 		 143 aa  90.9  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  37.23 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  39.23 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  34.59 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  43.31 
 
 		 139 aa  89  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 134 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  41.05 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  41.86 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  34.35 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  41.09 
 
 		 134 aa  87.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  41.73 
 
 		 132 aa  87.4  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  36.92 
 
 		 134 aa  87.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  45.88 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  37.68 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  35.77 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  45.79 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  37.86 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  47.37 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  33.85 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  38.76 
 
 		 134 aa  84.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 140 aa  84.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  32.82 
 
 		 139 aa  84.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0831  transcription antitermination protein NusB  33.83 
 
 		 144 aa  84.3  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000197838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  36.51 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  36.88 
 
 		 142 aa  84  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  40.48 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  38.4 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2438  NusB antitermination factor  44.9 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  36.23 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  47.06 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  33.59 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  39.53 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  39.06 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  42.99 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  40.8 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  37.98 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  37.98 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  37.62 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  35.88 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  38.64 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  37.21 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  37.4 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2372  NusB antitermination factor  50 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  39.06 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1578  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  39.47 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0884  transcription antitermination protein NusB  39.1 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  39.39 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  35.94 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0579  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  39.39 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  35.57 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  37.12 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  39.39 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  38.06 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  34.13 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  37.5 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  45.35 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  37.12 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  39.06 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>