253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1746 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
114 aa  230  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  43.24 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  42.34 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  42.34 
 
 
116 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
113 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  39.64 
 
 
116 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 
116 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 
111 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 
111 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  36.04 
 
 
120 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  37.62 
 
 
111 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  37.62 
 
 
111 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  41 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.41 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.45 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.28 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.13 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.91 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.23 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.03 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.23 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.07 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.07 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  29.07 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  31.13 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  34.95 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.76 
 
 
112 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.1 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.66 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
115 aa  57.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  27.91 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  21.93 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.91 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.85 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  22.81 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.91 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  25.69 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  25.47 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>