39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1637 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  35.12 
 
 
235 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  38.92 
 
 
233 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  33.33 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  30.46 
 
 
235 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  29.44 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  30.46 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  29.95 
 
 
235 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  30.22 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  30.22 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  30.22 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  30.22 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  30.22 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  30.22 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  30.22 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  28.72 
 
 
228 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  29.56 
 
 
214 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  28 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  28 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  27.71 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  26.51 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.360467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  30.88 
 
 
249 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  28.76 
 
 
222 aa  89  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0892  primosome, DnaD subunit  30.13 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2786  primosome, DnaD subunit  24.89 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  25.33 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0918  DNA replication protein DnaD  22.67 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.535006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  25.4 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  24.37 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0703  primosome, DnaD subunit  35.24 
 
 
409 aa  55.5  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2346  primosome, DnaD subunit  22.78 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000863397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0515  primosome, DnaD subunit  39.34 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_480  primosome component  39.34 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0539  DnaD and phage-associated domain-containing protein  39.34 
 
 
236 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0559  hypothetical protein  26.32 
 
 
286 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1148  primosome, DnaD subunit  32.14 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000149796  decreased coverage  0.00111014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  24.18 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2419  DNA replication protein DnaD  22.08 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3989  primosome, DnaD subunit  31.71 
 
 
239 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>