More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1432 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  100 
 
 
373 aa  749    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  68.71 
 
 
383 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  67.25 
 
 
382 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  65.99 
 
 
365 aa  471  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  60.27 
 
 
384 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  61.02 
 
 
381 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  61.88 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  63.66 
 
 
359 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  56.27 
 
 
404 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  58.65 
 
 
493 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  60.98 
 
 
346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  62.76 
 
 
366 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  63.34 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  63.05 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  62.76 
 
 
368 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  62.68 
 
 
377 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  59.64 
 
 
380 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  53.21 
 
 
378 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  52.96 
 
 
407 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  55.65 
 
 
382 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  57.1 
 
 
391 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  57.1 
 
 
391 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  56.65 
 
 
366 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  56.36 
 
 
366 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  54.65 
 
 
354 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  53.31 
 
 
444 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  54.91 
 
 
442 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  52.05 
 
 
491 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  51.59 
 
 
423 aa  371  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  51.75 
 
 
491 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  51.16 
 
 
442 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  52.02 
 
 
442 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  52.05 
 
 
487 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  51.72 
 
 
383 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  51.32 
 
 
360 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  50.38 
 
 
395 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  51.76 
 
 
382 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  51.76 
 
 
383 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  51.92 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  49.58 
 
 
381 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  51.16 
 
 
406 aa  348  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  51.03 
 
 
385 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  50.57 
 
 
365 aa  347  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  51.01 
 
 
401 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  47.55 
 
 
433 aa  346  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  48.85 
 
 
506 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  49.41 
 
 
531 aa  335  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  49.45 
 
 
385 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  49.85 
 
 
344 aa  335  9e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  49.56 
 
 
344 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  48.24 
 
 
552 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  50.28 
 
 
369 aa  332  6e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  47.18 
 
 
533 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  46.88 
 
 
535 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  46.89 
 
 
535 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  48.53 
 
 
537 aa  329  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  48.53 
 
 
537 aa  329  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  48.53 
 
 
536 aa  329  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  45.75 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  45.86 
 
 
475 aa  326  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  47.35 
 
 
538 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  50 
 
 
539 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  46.61 
 
 
532 aa  325  7e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  49.71 
 
 
541 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  50.29 
 
 
329 aa  324  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  49.71 
 
 
537 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  47.94 
 
 
538 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  50 
 
 
354 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  52.19 
 
 
330 aa  323  3e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  49.42 
 
 
537 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  49.42 
 
 
540 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  49.42 
 
 
536 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  49.3 
 
 
365 aa  322  9.000000000000001e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  49.12 
 
 
538 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  45.22 
 
 
440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  46.61 
 
 
544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  49.57 
 
 
361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  50.15 
 
 
344 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  46.05 
 
 
536 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  49.71 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  45.04 
 
 
491 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  46.76 
 
 
545 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  46.76 
 
 
560 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  46.76 
 
 
545 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  46.49 
 
 
449 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  47.06 
 
 
534 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  49.7 
 
 
358 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  46.76 
 
 
545 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  47.27 
 
 
351 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  48.7 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  48.13 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  47.06 
 
 
537 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  48.7 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>