More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1422 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  59.34 
 
 		 184 aa  224  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  57.8 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  54.95 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  53.07 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 186 aa  208  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  53.98 
 
 		 184 aa  207  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 184 aa  207  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 186 aa  205  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 183 aa  204  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 187 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 187 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 182 aa  198  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  51.14 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  52.87 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  54.44 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2152  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1363  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 188 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00468039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  53.41 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 173 aa  191  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  53.33 
 
 		 187 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  49.16 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2706  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.957438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 187 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>