More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1415 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  100 
 
 
154 aa  298  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  44.14 
 
 
159 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  44.93 
 
 
145 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  45.11 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  41.89 
 
 
163 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  37.06 
 
 
162 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.36 
 
 
167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.36 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  39.72 
 
 
158 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  33.78 
 
 
165 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.58 
 
 
170 aa  104  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.14 
 
 
183 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  42.37 
 
 
158 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  38.13 
 
 
167 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  41.53 
 
 
158 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35.86 
 
 
168 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  35.21 
 
 
154 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  33.33 
 
 
150 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.8 
 
 
165 aa  100  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.8 
 
 
165 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.68 
 
 
158 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.69 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.57 
 
 
168 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  36.76 
 
 
136 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  36.11 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  35.37 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  29.73 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  32.64 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  38.13 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  39.26 
 
 
164 aa  97.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  38.62 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  38.62 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  31.97 
 
 
168 aa  97.1  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  32.62 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  39.26 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  38.93 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.86 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.86 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  32.62 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  39.13 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  34.06 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  34.06 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  38.62 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  30.67 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  33.08 
 
 
262 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.81 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  37.24 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.48 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.57 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.79 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.72 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.17 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  35.17 
 
 
159 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  33.81 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.59 
 
 
159 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.25 
 
 
161 aa  94  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.09 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.17 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  33.58 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.96 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  34.06 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.89 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  31.91 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.48 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  36.81 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.48 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.79 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  32.39 
 
 
174 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.53 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  33.57 
 
 
155 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  38.46 
 
 
149 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.48 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  35 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  33.57 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  35.92 
 
 
173 aa  91.3  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34.72 
 
 
518 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  32.86 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  31.43 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  29.87 
 
 
187 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.79 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  31.88 
 
 
162 aa  90.5  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.79 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>