More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1321 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
314 aa  621  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  50.66 
 
 
310 aa  268  8e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  51.66 
 
 
359 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  51 
 
 
305 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 
318 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  47.6 
 
 
318 aa  250  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  47.67 
 
 
310 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  46.37 
 
 
327 aa  248  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  46.06 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  46.67 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  45.76 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.76 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  45.76 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  45.76 
 
 
315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  45.76 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  45.76 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  45.42 
 
 
315 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 
314 aa  242  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  44.85 
 
 
311 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  43.49 
 
 
314 aa  242  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 
314 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 
314 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 
314 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 
314 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 
314 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  46.41 
 
 
319 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  42.36 
 
 
314 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  42.36 
 
 
314 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  45.42 
 
 
315 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  48.84 
 
 
320 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  45.08 
 
 
315 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46.25 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  42.36 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 
317 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  46.2 
 
 
307 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  45.08 
 
 
315 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 
318 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  46.5 
 
 
331 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 
327 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  45.67 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  44.75 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  44.75 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  44.75 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 
297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  44.75 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  45.36 
 
 
315 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 
328 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  45.1 
 
 
312 aa  235  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
311 aa  235  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  43.33 
 
 
307 aa  235  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
311 aa  235  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  46.33 
 
 
310 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  44.77 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  46.35 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  43.77 
 
 
313 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  43.32 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 
329 aa  232  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 
302 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 
302 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 
323 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  42.71 
 
 
315 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  45.67 
 
 
299 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  47 
 
 
320 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  46.03 
 
 
311 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  43.58 
 
 
315 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  43.39 
 
 
315 aa  228  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  43.79 
 
 
309 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  41.89 
 
 
315 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  41.89 
 
 
315 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  41.89 
 
 
315 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.53 
 
 
320 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  44.26 
 
 
311 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 
313 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  43.59 
 
 
327 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 
307 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  45.18 
 
 
301 aa  225  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 
327 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 
327 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  44.49 
 
 
311 aa  225  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 
327 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 
313 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  47.33 
 
 
314 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 
327 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 
307 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 
330 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 
327 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  47.51 
 
 
308 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 
327 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 
319 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  43.81 
 
 
330 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  43.91 
 
 
327 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 
337 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 
337 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 
337 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  43.89 
 
 
306 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>