More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1216 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  623  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
308 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 
286 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
286 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  46.21 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
298 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.57 
 
 
297 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
279 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
356 aa  228  9e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
311 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
299 aa  215  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.13 
 
 
299 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  38.75 
 
 
325 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.09 
 
 
328 aa  205  8e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
293 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
311 aa  198  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
322 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
328 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  37 
 
 
311 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  37.54 
 
 
328 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
294 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00013616  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
295 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
328 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
291 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
324 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
287 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
306 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
302 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
299 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  36.06 
 
 
311 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  36.79 
 
 
321 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
331 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.36 
 
 
379 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
311 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0841  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.36 
 
 
337 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
325 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.738302  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
316 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
299 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
346 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.073402  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.94 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  34.72 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
317 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  32.63 
 
 
293 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7172  sugar transport system (permease)  33.22 
 
 
323 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
309 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
309 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
334 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
303 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
315 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
293 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
313 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
293 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
316 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
314 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  34.28 
 
 
294 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
326 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
307 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  36.59 
 
 
321 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
299 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.511569  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
321 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
312 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01240  permease component of ABC-type sugar transporter  41.11 
 
 
334 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.26 
 
 
318 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
305 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5408  carbohydrate ABC transporter membrane protein 1, CUT1 family  33.66 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
309 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
306 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
283 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  30.45 
 
 
315 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
319 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
325 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
307 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>