50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1140 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1140  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.311277  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3088  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  86.36 
 
 		 209 aa  362  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0544  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  83.84 
 
 		 209 aa  353  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0093  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000440627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0088  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0124  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0114  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5212  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000417002  unclonable  7.821880000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0104  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.05753e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0093  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000656402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000740123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0090  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.822440000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0093  RNA polymerase factor sigma-70  34.36 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0088  RNA polymerase factor sigma-70  34.33 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000937894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2728  RNA polymerase factor sigma-70  35.07 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0198  RNA polymerase factor sigma-70  35.27 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000245155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3319  RNA polymerase factor sigma-70  34.98 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000496723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2418  RNA polymerase factor sigma-70  34.47 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000693947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2732  RNA polymerase factor sigma-70  34.47 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2351  RNA polymerase factor sigma-70  34.31 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0946718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0192  RNA polymerase factor sigma-70  36.32 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000106571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2059  RNA polymerase factor sigma-70  33.85 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0269  RNA polymerase factor sigma-70  34.78 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000122079  normal  0.0102214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0094  RNA polymerase factor sigma-70  34.16 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000196498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0850  RNA polymerase factor sigma-70  33.66 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000558431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01000  RNA polymerase factor sigma-70  33.65 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0090  RNA polymerase factor sigma-70  34.29 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0407  RNA polymerase factor sigma-70  35.5 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000161705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2479  RNA polymerase factor sigma-70  36.27 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000414905  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0402  RNA polymerase factor sigma-70  36.6 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.38021e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0176  RNA polymerase factor sigma-70  34.6 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000382421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2041  RNA polymerase factor sigma-70  30.77 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000162862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1693  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.5 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.355338  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16490  RNA polymerase factor sigma-70  32.58 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3321  RNA polymerase factor sigma-70  29.15 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2812  RNA polymerase factor sigma-70  28.97 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0232  RNA polymerase factor sigma-70  25.65 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0346  RNA polymerase factor sigma-70  22.92 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0285516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0387  RNA polymerase factor sigma-70  26.18 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0041  RNA polymerase factor sigma-70  22.92 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0878225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0403  RNA polymerase factor sigma-70  26.18 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181976  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0885  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.23 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0843  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1422  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0109521  normal  0.320143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2095  RNA polymerase sigma factor RpoE  26.26 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1559  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  29.17 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0880  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0139812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  27.55 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4207  RNA polymerase sigma factor SigK  34.38 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  27.84 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>