More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1132 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
395 aa  818    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  59.39 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  58.18 
 
 
402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  51.06 
 
 
409 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  52.14 
 
 
399 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  48.59 
 
 
399 aa  333  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  44.25 
 
 
437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  45.99 
 
 
419 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
423 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.75 
 
 
313 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  31.51 
 
 
632 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.42 
 
 
313 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 
662 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  34.75 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
337 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.12 
 
 
362 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.53 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.68 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
359 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.77 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
328 aa  132  9e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 
335 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 
324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.81 
 
 
405 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 
412 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.6 
 
 
385 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.98 
 
 
395 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.25 
 
 
468 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.95 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 
379 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  36.45 
 
 
361 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.43 
 
 
451 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.76 
 
 
328 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
313 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  28.33 
 
 
443 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  27.3 
 
 
327 aa  108  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
488 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  26.35 
 
 
474 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 
416 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
421 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.59 
 
 
431 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 
368 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.57 
 
 
381 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  26.82 
 
 
440 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
406 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.27 
 
 
345 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  26.63 
 
 
352 aa  103  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
370 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  31.92 
 
 
319 aa  102  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.8 
 
 
431 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 
329 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
361 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  32.71 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.65 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.14 
 
 
362 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.06 
 
 
312 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 
319 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.49 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
356 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  25.24 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
331 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
464 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  26.94 
 
 
450 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  22.85 
 
 
360 aa  93.2  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  26.74 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 
361 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  23.7 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 
508 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
355 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.14 
 
 
424 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  26.15 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  30.5 
 
 
437 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 
318 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>