56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1067 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
82 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  90.24 
 
 
82 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  60.87 
 
 
72 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  46.25 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  40.79 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.16 
 
 
301 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  37.88 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
321 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  39.06 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  38.24 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  35.94 
 
 
117 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.58 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  31.58 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
231 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0910  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.67 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  42.19 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  42.19 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  38.46 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  33.82 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  39.39 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  40.62 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.81 
 
 
197 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  31.25 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  23.94 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  28.05 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  31.25 
 
 
144 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
115 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>