More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0981 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
357 aa  712    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.63 
 
 
361 aa  316  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.92 
 
 
340 aa  305  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.83 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  47.25 
 
 
336 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 
336 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 
336 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 
336 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.27 
 
 
364 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.56 
 
 
336 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.63 
 
 
349 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  48.38 
 
 
335 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.54 
 
 
357 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 
353 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 
339 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.55 
 
 
344 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.57 
 
 
340 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.45 
 
 
364 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  45.96 
 
 
356 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
356 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
356 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 
337 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
351 aa  292  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.12 
 
 
345 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  47.28 
 
 
367 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  48.38 
 
 
335 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 
356 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.67 
 
 
339 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 
336 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  47.83 
 
 
343 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 
351 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.67 
 
 
358 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.06 
 
 
336 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.84 
 
 
353 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 
344 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.34 
 
 
336 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 
339 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.27 
 
 
364 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.99 
 
 
347 aa  288  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.06 
 
 
336 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  46.78 
 
 
336 aa  288  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.37 
 
 
340 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 
343 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
336 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 
336 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  46.24 
 
 
355 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 
344 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.15 
 
 
342 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.14 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.79 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0409  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.86 
 
 
336 aa  286  4e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.845411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 
341 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 
342 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 
341 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 
340 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  45.03 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.08 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.89 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.83 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.9 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.9 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.9 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.99 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  47.83 
 
 
377 aa  281  8.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 
365 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 
365 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 
356 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.97 
 
 
349 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.33 
 
 
344 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 
331 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 
345 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.62 
 
 
363 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 
348 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.15 
 
 
339 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.15 
 
 
339 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 
341 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.15 
 
 
339 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.43 
 
 
348 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.95 
 
 
335 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  46.98 
 
 
374 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.14 
 
 
351 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  48.21 
 
 
363 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  48.21 
 
 
363 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 
352 aa  279  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  49.68 
 
 
375 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>