299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0875 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 712 aa  1441    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  42.96 
 
 		 689 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  42.82 
 
 		 689 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  42.82 
 
 		 689 aa  572  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  42.82 
 
 		 689 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  42.94 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  42.37 
 
 		 691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  42.53 
 
 		 689 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  42.25 
 
 		 691 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  43.08 
 
 		 689 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  42.39 
 
 		 689 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.11 
 
 		 763 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.11 
 
 		 763 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  31.25 
 
 		 760 aa  347  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  31.38 
 
 		 755 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  30.4 
 
 		 768 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  31.75 
 
 		 706 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  30.35 
 
 		 778 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  31.6 
 
 		 706 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  30.84 
 
 		 776 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.69 
 
 		 777 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  29.41 
 
 		 703 aa  283  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.25 
 
 		 776 aa  282  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  28.93 
 
 		 702 aa  280  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  29.96 
 
 		 777 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  29.58 
 
 		 748 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  30.1 
 
 		 777 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  30.94 
 
 		 753 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 778 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  31.41 
 
 		 702 aa  267  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  29.1 
 
 		 776 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  29.1 
 
 		 776 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  28.57 
 
 		 762 aa  245  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.17 
 
 		 768 aa  234  5e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  27.56 
 
 		 764 aa  228  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.78 
 
 		 706 aa  191  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.06 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  28.45 
 
 		 695 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  33.89 
 
 		 780 aa  180  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  38.14 
 
 		 785 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.25 
 
 		 670 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.11 
 
 		 736 aa  175  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.54 
 
 		 698 aa  168  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  40.54 
 
 		 772 aa  167  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  33.96 
 
 		 787 aa  164  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.15 
 
 		 724 aa  158  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.78 
 
 		 645 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  26.57 
 
 		 852 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.36 
 
 		 693 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  26.29 
 
 		 692 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.81 
 
 		 861 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  26.55 
 
 		 706 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  26.48 
 
 		 1048 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  38.39 
 
 		 759 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.32 
 
 		 716 aa  128  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.86 
 
 		 659 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  35.34 
 
 		 680 aa  127  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  35.93 
 
 		 759 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.86 
 
 		 758 aa  122  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.99 
 
 		 732 aa  120  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  32.55 
 
 		 719 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.44 
 
 		 832 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  40.38 
 
 		 726 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.23 
 
 		 672 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  34.75 
 
 		 684 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  37.12 
 
 		 758 aa  117  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  32.81 
 
 		 269 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.76 
 
 		 741 aa  117  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  32.82 
 
 		 717 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36 
 
 		 766 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  40.31 
 
 		 799 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 742 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  35.81 
 
 		 742 aa  114  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.55 
 
 		 691 aa  114  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.52 
 
 		 757 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  34.38 
 
 		 765 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  31.85 
 
 		 792 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  36.73 
 
 		 829 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  33.83 
 
 		 706 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  37.44 
 
 		 750 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.85 
 
 		 695 aa  111  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  35.27 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.44 
 
 		 804 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 679 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  36.8 
 
 		 726 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.93 
 
 		 748 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.57 
 
 		 767 aa  108  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  30 
 
 		 734 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  29.54 
 
 		 735 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  26.84 
 
 		 722 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.84 
 
 		 685 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.31 
 
 		 733 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.04 
 
 		 747 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  31.56 
 
 		 727 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  36.5 
 
 		 724 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  36.5 
 
 		 724 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  36.5 
 
 		 724 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  38.35 
 
 		 795 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  33.33 
 
 		 716 aa  104  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  31.01 
 
 		 771 aa  103  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>