More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0858 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  100 
 
 
106 aa  220  5e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  59.62 
 
 
108 aa  139  1e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  60 
 
 
108 aa  138  2e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  57.55 
 
 
107 aa  138  2e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  58.1 
 
 
108 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  130  4e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  57.14 
 
 
116 aa  129  1e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  61.46 
 
 
108 aa  129  1e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  54.81 
 
 
106 aa  127  5e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  56.73 
 
 
112 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  125  2e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  54.08 
 
 
106 aa  125  2e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.83291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  56.12 
 
 
112 aa  125  2e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  54.37 
 
 
110 aa  124  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  54.21 
 
 
107 aa  124  4e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  124  4e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  56.6 
 
 
106 aa  124  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  53.54 
 
 
106 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  123  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  123  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  57 
 
 
259 aa  122  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  53.54 
 
 
106 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  57.58 
 
 
115 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  54.64 
 
 
107 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  50.46 
 
 
109 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  52.88 
 
 
110 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  58.76 
 
 
104 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.56705e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  50.98 
 
 
106 aa  120  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  55.32 
 
 
107 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  2.65159e-07 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  56.25 
 
 
108 aa  120  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  120  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  54.37 
 
 
105 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.01022e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  55.56 
 
 
238 aa  120  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  55.45 
 
 
109 aa  120  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  52.88 
 
 
110 aa  120  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  53.47 
 
 
124 aa  120  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  58.76 
 
 
105 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  119  1e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  52.94 
 
 
106 aa  119  1e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  119  1e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  52.94 
 
 
112 aa  119  1e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  50.49 
 
 
141 aa  119  1e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  53.06 
 
 
106 aa  119  1e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  55.88 
 
 
110 aa  119  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  50.94 
 
 
106 aa  118  2e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  57.58 
 
 
259 aa  119  2e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  119  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  119  2e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  51.52 
 
 
106 aa  118  2e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  56.84 
 
 
108 aa  118  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  53.61 
 
 
104 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  53.61 
 
 
104 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  56.25 
 
 
108 aa  119  2e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  56.25 
 
 
108 aa  119  2e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  52.53 
 
 
106 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  54.64 
 
 
125 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  49.5 
 
 
108 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  52.04 
 
 
148 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  48.11 
 
 
107 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  53.4 
 
 
109 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  53.61 
 
 
104 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  56 
 
 
257 aa  117  4e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  117  4e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  48.57 
 
 
106 aa  117  5e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  48.57 
 
 
109 aa  117  5e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  52.43 
 
 
110 aa  117  5e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  117  5e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  51.96 
 
 
108 aa  117  5e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  117  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  117  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  50.51 
 
 
106 aa  117  5e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  52 
 
 
114 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  49.52 
 
 
108 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  50.51 
 
 
103 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  55 
 
 
120 aa  117  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  53.4 
 
 
108 aa  116  8e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  50.51 
 
 
106 aa  117  8e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.61 
 
 
107 aa  116  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  115  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  53.61 
 
 
108 aa  116  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.1 
 
 
107 aa  116  1e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  53.61 
 
 
108 aa  116  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  53.61 
 
 
108 aa  116  1e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  53.61 
 
 
108 aa  116  1e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>