More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0747 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  55.16 
 
 		 806 aa  773    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  52.25 
 
 		 706 aa  717    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  49.37 
 
 		 792 aa  681    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  54.74 
 
 		 806 aa  770    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  57.06 
 
 		 758 aa  794    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  55.02 
 
 		 808 aa  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  55.02 
 
 		 804 aa  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  54.74 
 
 		 810 aa  768    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  47.96 
 
 		 790 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  100 
 
 		 903 aa  1823    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  49.58 
 
 		 715 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  51.77 
 
 		 788 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  48.45 
 
 		 706 aa  648    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  55.02 
 
 		 808 aa  771    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  52.7 
 
 		 770 aa  711    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  54.88 
 
 		 792 aa  753    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  47.96 
 
 		 790 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  51.62 
 
 		 716 aa  700    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  56.17 
 
 		 762 aa  790    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  49.58 
 
 		 722 aa  677    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  53.18 
 
 		 757 aa  705    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  51.13 
 
 		 751 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  50.99 
 
 		 751 aa  695    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  54.17 
 
 		 814 aa  763    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  54.88 
 
 		 808 aa  769    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  54.74 
 
 		 812 aa  769    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  54.74 
 
 		 806 aa  770    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  45.92 
 
 		 709 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  46.33 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  43.93 
 
 		 705 aa  601  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  46.03 
 
 		 763 aa  594  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  45.82 
 
 		 759 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  45.32 
 
 		 763 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  43.26 
 
 		 810 aa  575  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  43.26 
 
 		 801 aa  572  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  44.26 
 
 		 752 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  42.77 
 
 		 774 aa  550  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  39.85 
 
 		 817 aa  546  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  43.14 
 
 		 777 aa  545  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  42 
 
 		 801 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  42.72 
 
 		 766 aa  535  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  42.67 
 
 		 737 aa  531  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  41.85 
 
 		 704 aa  525  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  42.51 
 
 		 710 aa  519  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  42.51 
 
 		 710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  43.89 
 
 		 726 aa  517  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  38.16 
 
 		 827 aa  509  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  43.92 
 
 		 737 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  43.32 
 
 		 737 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  41.5 
 
 		 779 aa  496  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  37.27 
 
 		 709 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  42.62 
 
 		 751 aa  492  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  39.46 
 
 		 758 aa  487  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  40.54 
 
 		 840 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  36.98 
 
 		 750 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  40.14 
 
 		 863 aa  484  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  39.8 
 
 		 722 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  40.14 
 
 		 819 aa  482  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  40.49 
 
 		 755 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  40.8 
 
 		 805 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  39.13 
 
 		 742 aa  479  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  39.1 
 
 		 842 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  39.17 
 
 		 937 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  36.44 
 
 		 735 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  36.93 
 
 		 818 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  39.44 
 
 		 735 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  39.27 
 
 		 871 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  40.08 
 
 		 1055 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  39.58 
 
 		 720 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  39.75 
 
 		 758 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  38.25 
 
 		 825 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  38.44 
 
 		 870 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  36.39 
 
 		 726 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  36.94 
 
 		 708 aa  464  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  38.31 
 
 		 864 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  38.67 
 
 		 895 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  39.6 
 
 		 836 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  39.86 
 
 		 838 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  40.47 
 
 		 813 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  38.53 
 
 		 896 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  38.53 
 
 		 812 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  38.53 
 
 		 838 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  38.53 
 
 		 896 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  38.26 
 
 		 827 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  38.53 
 
 		 838 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  38.53 
 
 		 838 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  38.53 
 
 		 886 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  38.49 
 
 		 876 aa  462  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  38.26 
 
 		 827 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  38.63 
 
 		 848 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  38.26 
 
 		 827 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  39.56 
 
 		 815 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  38.13 
 
 		 828 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  38.53 
 
 		 817 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  38.55 
 
 		 857 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  38.53 
 
 		 817 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  38.57 
 
 		 801 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  37.48 
 
 		 859 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  38.19 
 
 		 857 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  38.62 
 
 		 718 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>