More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0516 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  50.94 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  49.76 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.79 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  51.43 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.21 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  43.64 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 1648 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.6 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  41.59 
 
 		 216 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.41 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  42.92 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  42.92 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  43.4 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  42.86 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.64 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.98 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  41.04 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.97 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 209 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  41.04 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  41.04 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  41.63 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>