16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0482 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0482  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  268  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000178511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1600  hypothetical protein  48.48 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591491  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0071  hypothetical protein  56.18 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000941053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1714  hypothetical protein  45.74 
 
 
436 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1901  hypothetical protein  45.05 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000992457  hitchhiker  0.00299873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2461  hypothetical protein  42.22 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1263  hypothetical protein  40.23 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1165  hypothetical protein  40.23 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00139026  hitchhiker  1.4903800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1427  hypothetical protein  40.23 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000798357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2612  hypothetical protein  44.44 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3257  hypothetical protein  35.64 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.272475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1514  hypothetical protein  42.5 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2976  hypothetical protein  33.71 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0563  hypothetical protein  30.19 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.256478  hitchhiker  0.00135384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1375  hypothetical protein  60 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1085  hypothetical protein  55.88 
 
 
68 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000459218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>