59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0468 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
82 aa  166  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.57698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  90.24 
 
 
82 aa  149  9e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  57.97 
 
 
72 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 
127 aa  67  8e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 
125 aa  65.9  2e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
139 aa  64.7  4e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 
124 aa  62  3e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 
115 aa  57  9e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 
142 aa  56.2  1e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
78 aa  56.6  1e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  40 
 
 
145 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
137 aa  56.6  1e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  39.39 
 
 
301 aa  54.3  6e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
100 aa  52.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
117 aa  52  3e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  40.62 
 
 
117 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
133 aa  51.2  5e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
321 aa  50.8  6e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.36 
 
 
200 aa  50.1  1e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
143 aa  49.3  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
133 aa  49.3  2e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
152 aa  48.5  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
133 aa  48.1  5e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  37.5 
 
 
117 aa  47.8  5e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0910  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  35.29 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.75 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.75 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
231 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.38 
 
 
206 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 
248 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  42.19 
 
 
122 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  33.82 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.83783e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.81 
 
 
197 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1129  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 
252 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.12762e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>