More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0456 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  100 
 
 
326 aa  663    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  72.39 
 
 
325 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  72.09 
 
 
325 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  70.86 
 
 
325 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  70.25 
 
 
325 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  70.86 
 
 
325 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  70.25 
 
 
325 aa  471  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  69.94 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  69.94 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  69.94 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  69.94 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  69.94 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  69.94 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  69.94 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  65.03 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  65.03 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  66.35 
 
 
325 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  57.1 
 
 
325 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  57.05 
 
 
320 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  60.13 
 
 
326 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  55.42 
 
 
327 aa  378  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  58.95 
 
 
325 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  56 
 
 
326 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0050  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  56.79 
 
 
326 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0738  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  59.03 
 
 
326 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0632  transketolase domain-containing protein  57.88 
 
 
325 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  57.14 
 
 
335 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  57.76 
 
 
332 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  51.38 
 
 
320 aa  362  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  51.08 
 
 
320 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  53.7 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  54.98 
 
 
342 aa  352  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  53.54 
 
 
324 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  53.25 
 
 
346 aa  348  6e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  52.31 
 
 
324 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  52.31 
 
 
324 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  50.93 
 
 
320 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  52.62 
 
 
324 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  54.32 
 
 
331 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  52.16 
 
 
320 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  50.93 
 
 
324 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  51.23 
 
 
324 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  53.25 
 
 
327 aa  339  4e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  53.87 
 
 
328 aa  338  9e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  50.61 
 
 
326 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  49.69 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  48.47 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  50.88 
 
 
337 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  51.08 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  48.47 
 
 
326 aa  335  7.999999999999999e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  52.08 
 
 
325 aa  333  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.15 
 
 
341 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  49.69 
 
 
326 aa  332  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  50.29 
 
 
337 aa  332  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  50.29 
 
 
337 aa  332  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  50.29 
 
 
337 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  56.35 
 
 
334 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  48.92 
 
 
325 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.04 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  50.74 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  50.74 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  50.74 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.41 
 
 
337 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  52.5 
 
 
323 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  48.96 
 
 
332 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1135  transketolase central region  50.74 
 
 
347 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.770864  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1124  transketolase, central region  50.74 
 
 
347 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  49.25 
 
 
332 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  48.62 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.22 
 
 
351 aa  318  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  49.04 
 
 
326 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  50.64 
 
 
325 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  49.85 
 
 
345 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  49.41 
 
 
337 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.94 
 
 
337 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  51.38 
 
 
330 aa  316  3e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  52.16 
 
 
324 aa  315  7e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.21 
 
 
352 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  49.26 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1381  transketolase, central region  50.48 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0848887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01955  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase (E1) component, eukaryotic type, beta subunit  49.23 
 
 
325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  48.38 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  47.22 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  48.54 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  50.32 
 
 
326 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  51.54 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  50.31 
 
 
327 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  47.4 
 
 
327 aa  311  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  47.06 
 
 
337 aa  311  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.66 
 
 
347 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4507  hypothetical protein  49.69 
 
 
325 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2150  transketolase central region  50 
 
 
325 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00434594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1886  transketolase, central region  50.31 
 
 
325 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  48.66 
 
 
347 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  48.66 
 
 
347 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  48.29 
 
 
322 aa  311  1e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.66 
 
 
347 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2027  transketolase, central region  49.07 
 
 
325 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0248675  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1948  transketolase, central region  49.07 
 
 
325 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.858675  decreased coverage  0.000302013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2130  transketolase, central region  49.07 
 
 
325 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.88258  hitchhiker  0.000129918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>