More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0380 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  66.67 
 
 
544 aa  710    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  65.53 
 
 
546 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  63.88 
 
 
545 aa  659    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
544 aa  660    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  72 
 
 
539 aa  767    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.74 
 
 
545 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  64.44 
 
 
542 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  63.4 
 
 
547 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  72.45 
 
 
540 aa  762    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4376  chaperonin, 60 kDa  63.26 
 
 
547 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  79.21 
 
 
544 aa  832    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  79.4 
 
 
544 aa  833    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  79.4 
 
 
544 aa  833    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  65.15 
 
 
550 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
547 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  63.05 
 
 
546 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  67.23 
 
 
541 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  64.55 
 
 
537 aa  661    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  64.34 
 
 
547 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  63.21 
 
 
547 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  65.43 
 
 
542 aa  689    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  65.21 
 
 
545 aa  673    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  63.53 
 
 
548 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
544 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  64.92 
 
 
560 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  65.15 
 
 
546 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  64.39 
 
 
554 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  65.34 
 
 
548 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  64.6 
 
 
547 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  64.95 
 
 
551 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
546 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  65.13 
 
 
547 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
546 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
548 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  79.21 
 
 
544 aa  832    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  65.54 
 
 
555 aa  682    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  63.65 
 
 
544 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  63.26 
 
 
552 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  62.89 
 
 
543 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
548 aa  679    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  69.53 
 
 
539 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  72.38 
 
 
536 aa  760    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  65.15 
 
 
546 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
547 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  64.96 
 
 
541 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  67.29 
 
 
540 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
550 aa  678    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  64.66 
 
 
546 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  64.41 
 
 
551 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  63.15 
 
 
544 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  63.53 
 
 
540 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  63.53 
 
 
540 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  66.67 
 
 
550 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  63.45 
 
 
547 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  65.59 
 
 
546 aa  671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  63.24 
 
 
549 aa  665    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0616  chaperonin GroEL  64.53 
 
 
547 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0352411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  64.09 
 
 
553 aa  694    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  66.17 
 
 
545 aa  702    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  64.29 
 
 
547 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  63.79 
 
 
539 aa  670    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  64.64 
 
 
546 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
540 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  66.98 
 
 
541 aa  712    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  66.79 
 
 
540 aa  700    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  65.22 
 
 
544 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  67.47 
 
 
542 aa  710    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  65.22 
 
 
542 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  71.06 
 
 
539 aa  763    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  71.24 
 
 
539 aa  761    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  61.96 
 
 
561 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  71.65 
 
 
546 aa  762    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  64.02 
 
 
551 aa  673    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  64.64 
 
 
546 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
540 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  65.65 
 
 
547 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  69 
 
 
542 aa  739    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  67.59 
 
 
541 aa  727    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  70.3 
 
 
543 aa  759    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  69.44 
 
 
539 aa  744    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  70.76 
 
 
539 aa  738    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  66.04 
 
 
545 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  64.64 
 
 
546 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
540 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  66.22 
 
 
543 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  64.75 
 
 
542 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  63.77 
 
 
551 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  69.02 
 
 
539 aa  727    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
545 aa  661    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
554 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  63.57 
 
 
547 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  63.65 
 
 
545 aa  667    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  63.65 
 
 
545 aa  667    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  63.19 
 
 
541 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
541 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  66.98 
 
 
541 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  67.53 
 
 
541 aa  708    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  66.41 
 
 
547 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
544 aa  678    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  65.15 
 
 
550 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>