More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0110 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0240  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.8 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.87 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0537  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104238 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  25.12 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  30.61 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>