266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0109 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 
153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  61.87 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  63.57 
 
 
143 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  54.93 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 
152 aa  169  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  52.94 
 
 
155 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  53.29 
 
 
151 aa  164  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  53.29 
 
 
151 aa  164  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  51.02 
 
 
150 aa  153  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 
145 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.92 
 
 
144 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  48.92 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  50.67 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  47.89 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  55 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  50.67 
 
 
154 aa  140  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  56.43 
 
 
146 aa  140  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  49.32 
 
 
150 aa  138  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  46.53 
 
 
148 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  46.58 
 
 
148 aa  133  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  46.76 
 
 
142 aa  130  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  44.52 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  48.7 
 
 
146 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  43.59 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  45.99 
 
 
142 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  46.85 
 
 
163 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  46.51 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  55.05 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  45.74 
 
 
138 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  37.84 
 
 
154 aa  118  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 
137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  49.12 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  57.76 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  50.91 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  50.91 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  42.45 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  44.03 
 
 
141 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  36.49 
 
 
146 aa  112  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 
142 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  48.18 
 
 
142 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  37.14 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  44.03 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  49.14 
 
 
137 aa  110  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  45.95 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  50.83 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  44.83 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  41.04 
 
 
141 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  47.01 
 
 
132 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  51.4 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  45.76 
 
 
142 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  45.08 
 
 
136 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  45.08 
 
 
136 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  45.08 
 
 
136 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  45.08 
 
 
136 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  43.18 
 
 
137 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 
139 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  43.18 
 
 
137 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  45.13 
 
 
141 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  47.32 
 
 
154 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  49.58 
 
 
159 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
139 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  46.43 
 
 
144 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 
143 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  48 
 
 
145 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  47.71 
 
 
144 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  50.45 
 
 
143 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  47.93 
 
 
140 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  48.67 
 
 
137 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 
148 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  49.15 
 
 
134 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 
140 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
143 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  51.3 
 
 
142 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  44.35 
 
 
143 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 
137 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  48.33 
 
 
138 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  43.57 
 
 
145 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
140 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 
137 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 
136 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  43.08 
 
 
134 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
136 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  51.26 
 
 
141 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>