More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0106 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
586 aa  1174  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.31 
 
 
565 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.31 
 
 
565 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.76 
 
 
568 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.83 
 
 
589 aa  363  5e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.03 
 
 
561 aa  363  5e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.02 
 
 
559 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.75 
 
 
562 aa  360  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.27385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.73 
 
 
562 aa  359  1e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.56 
 
 
562 aa  356  6e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.37 
 
 
562 aa  356  7e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.01 
 
 
562 aa  354  3e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.01 
 
 
562 aa  354  3e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.4 
 
 
527 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.03 
 
 
562 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.27 
 
 
547 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.32 
 
 
562 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.09 
 
 
547 aa  349  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.8 
 
 
589 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.79 
 
 
547 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.97 
 
 
562 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.52 
 
 
562 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.46 
 
 
562 aa  342  9e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.33 
 
 
562 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.03 
 
 
540 aa  339  1e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.13 
 
 
550 aa  336  6e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  44.66 
 
 
548 aa  336  6e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.06 
 
 
554 aa  336  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.2733e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.46 
 
 
611 aa  330  3e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.88 
 
 
522 aa  327  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  56.12 
 
 
447 aa  322  1e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  3.24435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.49 
 
 
588 aa  320  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.38 
 
 
582 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.58 
 
 
518 aa  314  3e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.04 
 
 
550 aa  313  6e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.97 
 
 
534 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  46.13 
 
 
499 aa  311  3e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.19 
 
 
695 aa  308  1e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.49 
 
 
579 aa  307  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.69 
 
 
602 aa  307  4e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  35.25 
 
 
582 aa  306  9e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  40.2 
 
 
579 aa  304  3e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.41 
 
 
554 aa  303  6e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.77 
 
 
582 aa  303  8e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.87 
 
 
579 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 
647 aa  299  9e-80  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.98 
 
 
478 aa  299  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.08 
 
 
551 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.98 
 
 
478 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.76 
 
 
900 aa  298  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.89 
 
 
517 aa  297  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.6 
 
 
606 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  41.37 
 
 
650 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.86 
 
 
569 aa  296  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.51 
 
 
427 aa  296  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.32 
 
 
460 aa  295  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  31.74 
 
 
602 aa  295  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  44.07 
 
 
807 aa  293  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.55 
 
 
467 aa  293  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.14 
 
 
567 aa  293  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.6 
 
 
601 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.6 
 
 
601 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.11 
 
 
553 aa  291  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.59 
 
 
570 aa  290  5e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.28 
 
 
518 aa  290  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.66 
 
 
570 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.31282e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.78 
 
 
735 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.16 
 
 
610 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.02 
 
 
562 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  35.71 
 
 
575 aa  286  6e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.33 
 
 
606 aa  286  6e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  34.48 
 
 
559 aa  285  1e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.55 
 
 
732 aa  284  3e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.37 
 
 
663 aa  284  4e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.03 
 
 
599 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.84 
 
 
580 aa  280  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.82 
 
 
649 aa  279  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.27 
 
 
602 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.13 
 
 
730 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.35 
 
 
582 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  39.85 
 
 
652 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.92 
 
 
637 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  4.10993e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.87 
 
 
395 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.44 
 
 
755 aa  277  4e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.59 
 
 
690 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.43 
 
 
682 aa  276  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.07 
 
 
664 aa  276  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.93 
 
 
752 aa  275  1e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.73 
 
 
650 aa  275  1e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.22 
 
 
621 aa  275  2e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.73 
 
 
648 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.19 
 
 
602 aa  274  4e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.22 
 
 
608 aa  273  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.89 
 
 
612 aa  273  9e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.13 
 
 
613 aa  273  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.04981e-05  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.48 
 
 
634 aa  273  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.58 
 
 
723 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.98 
 
 
626 aa  272  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.94 
 
 
565 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.28 
 
 
496 aa  271  3e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>