15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0071 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0071  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000941053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1600  hypothetical protein  51.58 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591491  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0482  hypothetical protein  56.18 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000178511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1901  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000992457  hitchhiker  0.00299873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1714  hypothetical protein  47.19 
 
 
436 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2612  hypothetical protein  46.24 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2461  hypothetical protein  40.22 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1263  hypothetical protein  38.89 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1165  hypothetical protein  38.89 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00139026  hitchhiker  1.4903800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1427  hypothetical protein  38.89 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000798357  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0970  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.875202  hitchhiker  0.00000000905134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3257  hypothetical protein  36.96 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.272475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2976  hypothetical protein  32.26 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1514  hypothetical protein  38.75 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0563  hypothetical protein  35.42 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.256478  hitchhiker  0.00135384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>