More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0058 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
234 aa  469  1e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
227 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  8.93003e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 
277 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  127  1e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 
225 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
224 aa  119  5e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
253 aa  118  8e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
227 aa  117  1e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 
234 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
257 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
228 aa  115  8e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
230 aa  114  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
235 aa  114  1e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
242 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
228 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 
228 aa  110  1e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 
228 aa  111  1e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
264 aa  110  2e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0843233  normal  0.231576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
264 aa  110  2e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
234 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 
232 aa  109  4e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
226 aa  108  8e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
248 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
244 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  27.9 
 
 
231 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
255 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 
228 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
237 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 
228 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 
234 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 
241 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 
229 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 
237 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 
229 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 
235 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  29.82 
 
 
231 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  28.82 
 
 
239 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
235 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
265 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 
230 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 
238 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  29.63 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
228 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.99292e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 
231 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
228 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
228 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.51748e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 
228 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.56729e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
228 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.22448e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 
228 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 
227 aa  99  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  28.38 
 
 
228 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.49692e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.38 
 
 
228 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.22433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.48 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
238 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
238 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.55657e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.81506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 
239 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
228 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 
228 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
223 aa  89  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 
228 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
226 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 
239 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 
225 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
250 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 
232 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 
223 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  9.72767e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>