More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0014 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
426 aa  870    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 
427 aa  542  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  60.52 
 
 
424 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  60.62 
 
 
424 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
427 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  59.9 
 
 
424 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
424 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
424 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
424 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
424 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
424 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
424 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 
424 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
424 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
424 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  56.84 
 
 
424 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  61.58 
 
 
424 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  60 
 
 
424 aa  524  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
423 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
423 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
422 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
422 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
422 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
423 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  58.13 
 
 
422 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
423 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 
425 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 
421 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
422 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
420 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
423 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
428 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
428 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
428 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 
423 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  56.32 
 
 
422 aa  486  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
425 aa  484  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  56 
 
 
425 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
425 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
425 aa  482  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
426 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
427 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
425 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
424 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
422 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  52.71 
 
 
427 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
423 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  53.49 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
422 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
423 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
423 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
425 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
423 aa  458  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
435 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
425 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
427 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
424 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
424 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
424 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
425 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
417 aa  428  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
427 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 
427 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1278  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
423 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.483732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
421 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
430 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
423 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
421 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
431 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
424 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
435 aa  427  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
431 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
428 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0575  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
426 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0551  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
426 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
430 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
430 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
426 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
431 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
428 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
433 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
428 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
428 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
428 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
425 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  51.66 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1971  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
427 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.140828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
428 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
426 aa  413  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
428 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>