149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0003 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  100 
 
 
76 aa  150  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.48 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  57.58 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  55.07 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  56.45 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  48.48 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  52.17 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  58.62 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  51.43 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  50.85 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  59.32 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.24 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  46.88 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  60.38 
 
 
73 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  53.12 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  44.12 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  51.56 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  50 
 
 
70 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
74 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
74 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
74 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  63.46 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  50.85 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  51.52 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  46.88 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  47.76 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  61.11 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  56.25 
 
 
58 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  47.54 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  43.94 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.76 
 
 
78 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  47.69 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  44.62 
 
 
72 aa  57  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  42.03 
 
 
71 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  50 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  43.94 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  51.43 
 
 
73 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  47.46 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  45.59 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  44.07 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  56.86 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  42.42 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  42.42 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  56.25 
 
 
58 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.27 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  42.42 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  43.08 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  54.17 
 
 
58 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.15 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.28 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.45 
 
 
72 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  45.45 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.45 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.91 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  54.17 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  45.9 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.19 
 
 
71 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  50.88 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  37.33 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.63 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  49.02 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  44.07 
 
 
71 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000219  hypothetical protein  45 
 
 
177 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05955  hypothetical protein  45 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  47.37 
 
 
73 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.37 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  45.45 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  49.12 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0409  hypothetical protein  38.67 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000857637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  36.76 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  39.13 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1502  RNA-binding S4  44.07 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1157  hypothetical protein  40.91 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0334901  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0526  hypothetical protein  38.81 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  48 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  48 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3548  RNA-binding S4 domain protein  48.28 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101956  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  49.12 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  40.3 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  41.94 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  42.86 
 
 
49 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  48 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  40.58 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.1 
 
 
74 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  48.08 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  43.86 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0110  hypothetical protein  41.43 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6671  hypothetical protein  41.67 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.0976686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3069  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.1 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000897832  hitchhiker  0.000868663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0972  hypothetical protein  40.35 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0910033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>