More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03933 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03933  DNA-directed RNA polymerase I subunit beta (Rpa2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08300)  100 
 
 
1231 aa  2573    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77977  DNA-directed RNA polymerase I  59.61 
 
 
1167 aa  1506    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.481222 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04080  DNA-directed RNA polymerase i polypeptide 2, putative  52.32 
 
 
1193 aa  1306    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119522  DNA-directed RNA polymerase I polypeptide 2  39.02 
 
 
1145 aa  825    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.050944  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9235  predicted protein  43.58 
 
 
1147 aa  969    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0449  DNA-directed RNA polymerase subunit B  32.92 
 
 
1131 aa  452  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000490732  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0703  DNA-directed RNA polymerase subunit B  31.37 
 
 
1127 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.347908  decreased coverage  0.0027158 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2321  DNA-directed RNA polymerase subunit B  30.62 
 
 
1127 aa  431  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.388752  hitchhiker  0.000074653 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0286  DNA-directed RNA polymerase subunit B  30.39 
 
 
1130 aa  433  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1963  DNA-directed RNA polymerase subunit B  30.98 
 
 
1127 aa  428  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  30.75 
 
 
1127 aa  421  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00420  DNA-directed RNA polymerase, putative  30.04 
 
 
1129 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39835  predicted protein  30.45 
 
 
1146 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.695228  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54289  predicted protein  29.23 
 
 
1211 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13673  predicted protein  28.63 
 
 
1174 aa  396  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320085  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0033  DNA-directed RNA polymerase subunit B  29.35 
 
 
1124 aa  394  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000339757  normal  0.0488457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1204  DNA-directed RNA polymerase subunit B  29.39 
 
 
1124 aa  390  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.074104  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87381  DNA-directed RNA polymerase III  29.7 
 
 
1155 aa  390  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200295  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11441  predicted protein  29.39 
 
 
1212 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.41683  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00321  DNA-directed RNA polymerase III, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02460)  27.7 
 
 
1225 aa  377  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0578929  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0347  DNA-directed RNA polymerase subunit B  27.77 
 
 
1115 aa  374  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  39.57 
 
 
604 aa  320  7e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  39.57 
 
 
604 aa  320  7e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  36.9 
 
 
1201 aa  307  7e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00610767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0028  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  38.32 
 
 
604 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.274287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2151  DNA-directed RNA polymerase subunit B  36.5 
 
 
609 aa  304  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1933  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  38.3 
 
 
604 aa  304  8.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09120  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV95]  38.88 
 
 
1252 aa  303  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3693  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  39.41 
 
 
604 aa  302  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.256816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1162  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  36.95 
 
 
637 aa  302  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.595392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0352  DNA-directed RNA polymerase subunit B  37.5 
 
 
609 aa  300  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0607  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  36.5 
 
 
611 aa  300  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1311  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  36.29 
 
 
611 aa  299  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0790  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  33.16 
 
 
611 aa  299  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2160  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  34.56 
 
 
604 aa  298  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0554265  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  36.29 
 
 
611 aa  297  8e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0672  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  36.97 
 
 
611 aa  294  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03540  DNA-dependent RNA polymerase II RPB140, putative  29.66 
 
 
1193 aa  293  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.85133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0051  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  36.02 
 
 
606 aa  293  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0783  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  36.23 
 
 
608 aa  291  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34146  DNA-dependent RNA polymerase II  37.72 
 
 
1232 aa  291  6e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19062  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0514  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  37.05 
 
 
608 aa  291  7e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1178  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  37.32 
 
 
604 aa  290  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000367699  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0106  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  35.49 
 
 
609 aa  283  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.49863  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  31.04 
 
 
1197 aa  161  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.85 
 
 
1141 aa  159  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0391  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.56 
 
 
1155 aa  158  5.0000000000000005e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0804  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.16 
 
 
1228 aa  158  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0442499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.11 
 
 
1202 aa  156  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0708  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  32.31 
 
 
1203 aa  155  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  30.56 
 
 
1126 aa  155  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  32.05 
 
 
1176 aa  155  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.83 
 
 
1115 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.27 
 
 
1284 aa  154  8.999999999999999e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.14 
 
 
1100 aa  152  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.32 
 
 
1193 aa  152  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.4 
 
 
1250 aa  152  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.3 
 
 
1202 aa  152  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2421  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.17 
 
 
1167 aa  152  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.64 
 
 
1246 aa  152  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01090  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  30.75 
 
 
1090 aa  152  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000929297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1958  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  31.96 
 
 
1173 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.93 
 
 
1191 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.61 
 
 
1102 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  31.02 
 
 
1070 aa  149  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.4 
 
 
1122 aa  149  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.19 
 
 
1234 aa  148  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.19 
 
 
1234 aa  148  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0741  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.14 
 
 
1096 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  22.74 
 
 
1095 aa  147  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.68 
 
 
1145 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.79 
 
 
1117 aa  147  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  29.92 
 
 
1174 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1751  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.52 
 
 
1103 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1778  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.52 
 
 
1103 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.32 
 
 
1096 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.6 
 
 
1095 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.72 
 
 
1097 aa  145  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.99 
 
 
1097 aa  146  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.87 
 
 
1183 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.43 
 
 
1287 aa  145  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.87 
 
 
1183 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.22 
 
 
1196 aa  145  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.41 
 
 
1097 aa  145  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.6 
 
 
1183 aa  145  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.72 
 
 
1212 aa  145  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.33 
 
 
1190 aa  145  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1169  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  26.35 
 
 
1188 aa  144  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0246464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2707  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.22 
 
 
1227 aa  144  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.608751  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16891  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.41 
 
 
1097 aa  144  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0443  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  39.9 
 
 
1238 aa  144  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0278  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.89 
 
 
1227 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00054451  hitchhiker  0.000191986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.33 
 
 
1185 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000686573  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.46 
 
 
1097 aa  143  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.3 
 
 
1245 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0310456  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1705  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.79 
 
 
1124 aa  143  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.94 
 
 
1229 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.81 
 
 
1155 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.41 
 
 
1177 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5203  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.41 
 
 
1177 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000890566  unclonable  1.148e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>