29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02543 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  100 
 
 
606 aa  1236    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36.21 
 
 
848 aa  346  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  32.91 
 
 
676 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  31.21 
 
 
616 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  30.72 
 
 
914 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  31.03 
 
 
773 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  30.67 
 
 
1266 aa  230  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  33.54 
 
 
662 aa  229  9e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  32.92 
 
 
613 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  31.3 
 
 
743 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  30.8 
 
 
1880 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  32.21 
 
 
746 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.22 
 
 
833 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  30.08 
 
 
1065 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  31.33 
 
 
618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  28.98 
 
 
787 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  31.43 
 
 
744 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  30.44 
 
 
820 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  30.43 
 
 
658 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  29.43 
 
 
672 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  29.36 
 
 
677 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  29.35 
 
 
774 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  31.77 
 
 
669 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  30.68 
 
 
851 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  28.5 
 
 
767 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  27.68 
 
 
1082 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  31.17 
 
 
240 aa  107  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  27.03 
 
 
803 aa  90.5  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  25.11 
 
 
667 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>