61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_01970 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01970  50S ribosomal protein L24 (AFU_orthologue; AFUA_4G10740)  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000553302  hitchhiker  0.00696357 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43496  predicted protein  35 
 
 		 266 aa  92.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31348  Putative mitochondrial ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0815  50S ribosomal protein L28P  43.84 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00548085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11953  predicted protein  43.06 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.524499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0077  50S ribosomal protein L28  35.96 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0918  50S ribosomal protein L28  40.58 
 
 		 99 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  38.3 
 
 		 98 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2702  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 100 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.645172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4041  50S ribosomal protein L28  36.26 
 
 		 96 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2015  50S ribosomal protein L28  37.68 
 
 		 97 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2556  50S ribosomal protein L28  36.78 
 
 		 96 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3879  50S ribosomal protein L28  37.65 
 
 		 98 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2583  50S ribosomal protein L28  35.62 
 
 		 95 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  hitchhiker  0.000206552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3586  50S ribosomal protein L28  35.63 
 
 		 99 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1939  50S ribosomal protein L28  36.23 
 
 		 97 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2290  50S ribosomal protein L28P  36.99 
 
 		 94 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.798347 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1743  50S ribosomal protein L28  35.94 
 
 		 72 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5333  50S ribosomal protein L28  39.68 
 
 		 78 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5192  50S ribosomal protein L28  39.68 
 
 		 78 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244386  normal  0.27276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5282  50S ribosomal protein L28  39.68 
 
 		 78 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1706  ribosomal protein L28  35.21 
 
 		 96 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298702  normal  0.0538671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3114  50S ribosomal protein L28  32.91 
 
 		 96 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.878513  hitchhiker  0.00268781 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0484  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 100 aa  45.1  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.167869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  37.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 78 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0589  50S ribosomal protein L28  37.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.74438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  36.99 
 
 		 91 aa  44.7  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 78 aa  44.7  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0726  50S ribosomal protein L28  32.91 
 
 		 96 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140106  normal  0.323515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  30.49 
 
 		 96 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1468  ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 78 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255813  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2750  50S ribosomal protein L28  35 
 
 		 97 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3160  50S ribosomal protein L28  34.33 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.75294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2016  50S ribosomal protein L28  32.91 
 
 		 96 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1989  50S ribosomal protein L28  36.51 
 
 		 78 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1710  50S ribosomal protein L28  36.51 
 
 		 78 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2641  50S ribosomal protein L28P  37.1 
 
 		 78 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0542  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0666113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0582  50S ribosomal protein L28  32.31 
 
 		 72 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3302  50S ribosomal protein L28  32.31 
 
 		 100 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592148  normal  0.0516815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2326  50S ribosomal protein L28  35 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.972077  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0321  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 102 aa  43.1  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2978  50S ribosomal protein L28  32.84 
 
 		 101 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3701  50S ribosomal protein L28  34.38 
 
 		 100 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3204  50S ribosomal protein L28  32.84 
 
 		 101 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0494  50S ribosomal protein L28  34.33 
 
 		 101 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  34.29 
 
 		 78 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0222  50S ribosomal protein L28  36.67 
 
 		 94 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2640  ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3424  50S ribosomal protein L28  29.07 
 
 		 96 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0875436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0325  50S ribosomal protein L28  34.92 
 
 		 96 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0210  50S ribosomal protein L28  32.81 
 
 		 99 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0481  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0546  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 78 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  35.29 
 
 		 77 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0391  50S ribosomal protein L28  35.29 
 
 		 104 aa  41.2  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0055  ribosomal protein L28  34.92 
 
 		 78 aa  41.2  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378886  normal  0.0544728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7548  50S ribosomal protein L28  32.84 
 
 		 102 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>