23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00643 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60739  signal recognition particle subunit  36.61 
 
 
276 aa  117  2e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.022276  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  41.41 
 
 
355 aa  80.5  2e-14  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10601  predicted protein  38.54 
 
 
105 aa  67  3e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  42.05 
 
 
113 aa  61.6  1e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.88 
 
 
89 aa  59.3  5e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  39.44 
 
 
93 aa  58.9  7e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  41.54 
 
 
89 aa  56.6  4e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  41.43 
 
 
89 aa  56.6  4e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  39.13 
 
 
92 aa  55.1  1e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  39.39 
 
 
93 aa  53.9  2e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.78 
 
 
92 aa  53.9  2e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.78 
 
 
90 aa  54.3  2e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  38.89 
 
 
103 aa  53.9  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44439  predicted protein  31.08 
 
 
210 aa  51.2  2e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40 
 
 
100 aa  50.1  3e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.33 
 
 
89 aa  50.1  3e-05  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  42.42 
 
 
90 aa  50.1  4e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  41.94 
 
 
91 aa  48.9  9e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.98 
 
 
92 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  42.42 
 
 
101 aa  46.6  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35 
 
 
87 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  32.81 
 
 
104 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>