More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3236 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  55.16 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  51.85 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  51.62 
 
 
321 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  53.62 
 
 
301 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  49.19 
 
 
304 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  49.51 
 
 
304 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  48.54 
 
 
304 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  48.54 
 
 
304 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  51.13 
 
 
320 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  49.84 
 
 
304 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  52.96 
 
 
311 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  51.45 
 
 
320 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  49.67 
 
 
315 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  48.22 
 
 
320 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  48.22 
 
 
373 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  48.86 
 
 
304 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  48.86 
 
 
306 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  48.86 
 
 
351 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  48.86 
 
 
304 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  48.86 
 
 
304 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  48.86 
 
 
351 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  48.86 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  47.9 
 
 
304 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  47.9 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  47.9 
 
 
326 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  53.29 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  48.21 
 
 
307 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  49.19 
 
 
304 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  50.33 
 
 
303 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  50.67 
 
 
327 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  47.71 
 
 
304 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  49.33 
 
 
302 aa  279  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  45.83 
 
 
313 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  48.36 
 
 
312 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  50.33 
 
 
310 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  46.5 
 
 
314 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  51.96 
 
 
325 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  50.65 
 
 
323 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  47.39 
 
 
304 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  50 
 
 
310 aa  272  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  47.65 
 
 
312 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  48.17 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
311 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  46.77 
 
 
345 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  47.73 
 
 
309 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  48.23 
 
 
312 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  49.68 
 
 
315 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  47.42 
 
 
306 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  44.63 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  47.02 
 
 
342 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  48.69 
 
 
311 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  47.04 
 
 
293 aa  258  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  44.15 
 
 
305 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  46.49 
 
 
308 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  47.73 
 
 
339 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  48.33 
 
 
326 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  49.02 
 
 
332 aa  255  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  49.18 
 
 
317 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  45.87 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  48.49 
 
 
340 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  44.77 
 
 
307 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.34 
 
 
317 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  46.03 
 
 
328 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  44.55 
 
 
303 aa  242  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
313 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  41.42 
 
 
305 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  44.26 
 
 
305 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  41.42 
 
 
305 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  41.42 
 
 
305 aa  219  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.15 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 
308 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.5 
 
 
311 aa  205  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 
308 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 
324 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 
312 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 
312 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 
312 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 
312 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
312 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
312 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  35.6 
 
 
312 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.46 
 
 
309 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 
312 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.02 
 
 
309 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 
312 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  39.55 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.8 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  36.54 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  45.91 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
308 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.95 
 
 
319 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>