More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3136 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  100 
 
 
417 aa  856    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
424 aa  857    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
421 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  36.49 
 
 
449 aa  275  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
430 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
479 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
423 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.67 
 
 
414 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
418 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
418 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
417 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
420 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  34.16 
 
 
419 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  32.85 
 
 
450 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  34.85 
 
 
422 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  34.58 
 
 
422 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  33.67 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  31.58 
 
 
443 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  31.73 
 
 
465 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  30.9 
 
 
442 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
419 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  33.89 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  32.92 
 
 
419 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
436 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
426 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  31.81 
 
 
449 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
437 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
436 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
426 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
426 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
426 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
426 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
426 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
426 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  33.33 
 
 
426 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
472 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
467 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
476 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
476 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  33.17 
 
 
476 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
449 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  30.62 
 
 
436 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  30.88 
 
 
442 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.29 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  28.1 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  29.72 
 
 
429 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  28.37 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
435 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  30.51 
 
 
433 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
436 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
459 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
457 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  28.47 
 
 
452 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
464 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  27.73 
 
 
446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  27.64 
 
 
422 aa  162  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
420 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  29.21 
 
 
442 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  25.71 
 
 
449 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
444 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
422 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
444 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
452 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
440 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
468 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0064  two component sensor kinase  27.01 
 
 
434 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  28.08 
 
 
463 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0133  sensor histidine kinase  28.19 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 
440 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
415 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  28.81 
 
 
440 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0128  sensor histidine kinase  28.19 
 
 
430 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00320906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
441 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
448 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.0681596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  30.6 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  26.85 
 
 
462 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
462 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.916749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
423 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0359  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 
440 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
463 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  28.47 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
461 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289635  decreased coverage  0.00139676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>