263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3117 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  100 
 
 		 76 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  57.89 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  47.89 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  47.14 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  47.89 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  44 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  36.99 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  34.25 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  34.25 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  36.99 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  40.58 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  40.3 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  36.11 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  36.23 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  42.03 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  36.23 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2416  SirA family protein  46.15 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0668524  normal  0.999946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  39.66 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  28.95 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  35.21 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  38.71 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  37.14 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.72 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  37.14 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  40.35 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  39.44 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  35.71 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  31.51 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  35.71 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  39.44 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  39.44 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.03 
 
 		 938 aa  54.3  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  38.03 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  33.8 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  34.43 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  36.84 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  39.71 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.26 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  32.79 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  34.29 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  31.94 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  36.23 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  31.43 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  34.29 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  31.94 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  36.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.87 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  32.43 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  32 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  37.68 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  32.84 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  38.03 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  32.86 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.29 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 354 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 354 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  32.26 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  33.87 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  31.94 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  35.62 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  31.88 
 
 		 356 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  34.29 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  35.21 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  29.03 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  37.7 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  29.51 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  31.08 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  30.26 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  33.93 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  33.93 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  31.94 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  31.03 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  36.51 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.7 
 
 		 817 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  33.93 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  31.75 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  36.11 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  35.21 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  33.93 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  34.29 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  31.34 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.51 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>