More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2978 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  99.57 
 
 		 250 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  37.65 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.58 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  34.51 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  28.31 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  36.63 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  31.68 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.06 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2400  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.83 
 
 		 420 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  33.01 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28 
 
 		 442 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  37.27 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 2490 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0134  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.16 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  32.71 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  26.03 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.85 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.55 
 
 		 415 aa  52  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  29.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.87 
 
 		 408 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.5 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.27 
 
 		 416 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  42.65 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.5 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  37.5 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.89 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.37 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  34.38 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2017  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.56 
 
 		 435 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.421548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3428  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.06 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.97 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  38.81 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.61 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32 
 
 		 430 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.28 
 
 		 1635 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.37 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.12 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  31.67 
 
 		 400 aa  48.5  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.05 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  29.86 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.94 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.78 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.14 
 
 		 482 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  35.53 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2160  putative cyclopropane fatty acid synthase  34.02 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.12 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3041  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.15 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.178354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  34.86 
 
 		 503 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.37 
 
 		 330 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  29.06 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.85 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  29.93 
 
 		 631 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  33.64 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  31.31 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0129  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.56 
 
 		 403 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.483434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2233  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.41 
 
 		 465 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.39 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.41 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0719078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.16 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  30.53 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0057  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.41 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.41 
 
 		 465 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191948  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.38 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>